資格を取得したあとすぐに退職された。会社が負担した費用は返してもらえるの？

資格取得までの背景により次の２つのケースで扱いが異なります。

①会社の業務命令として、または福利厚生として取得させた場合

この場合は返還を求めることはできません。
なぜなら、労働基準法で次のような行為が禁止されているためです。
・労働契約の不履行について違約金を定めること
・損害賠償額の予定をする契約
その趣旨は、労働者の退職の自由が制約されるのを防ぐということです。

②資格取得の費用を（労働契約とは別の契約として）「貸付けた」場合

上記①のように、退職の自由を損なわない「貸付け契約」をしていたのであれば、これを返還してもらうのは問題がありません。
実務上では「取得後○年以上を勤務することで、返済を免除する」としておく等の方法があります。
この場合でも、
上記①とみなされないように、貸し付けの契約書を締結しておくことが重要です。