社内ルールを守らない社員へ会社はどう対応すべきですか？

社内ルールを守らない場合、企業秩序遵守義務を果たしていないものとして改善を求めます。
労働者は職場のルールを守る義務があります。
これを企業秩序遵守義務といい、雇用契約に付随する労働者の義務のひとつでとされています。

また一般的な就業規則の服務規律には、「会社のルールを守り、秩序を乱さないこと」
というルールが記載されており、このルールに違反していることにもなります。

これを改善させるためには、
注意・指導→制裁→解雇（諭旨解雇、懲戒解雇を含む）という流れで進めていくことになります。

（留意点）
社内ルールは、就業規則に定めるだけでなく、周知することが必要です。
「就業規則を見せてもらえない」「どこにあるか分からない」という状態は周知しているとは言い難いです。